Od roku 2013 prof. Błażej Skoczeń pełni funkcję członka Komitetu Ewaluacji Jednostek Naukowych (KEJN), który jest organem opiniodawczo-doradczym ministra nauki i szkolnictwa wyższego. Minister powołuje członków Komitetu spośród kandydatów zgłoszonych przez środowisko naukowe i środowiska społeczno-gospodarcze. Kadencja trwa cztery lata.